6月30日からの大雨の影響により、西日本を中心とした地域で鉄道路線の運転見合わせが続いている。国土交通省がまとめた7月6日4時30分時点の情報によると、運休区間は以下の通り。
●黒部峡谷鉄道
本線 ※全線
●JR西日本
山陰本線 浜田～益田
●JR九州
日田彦山線 添田～夜明
久大本線 善導寺～日田・向之原～由布院
豊肥本線 三重町～中判田
●西日本鉄道
甘木線 ※全線
黒部峡谷鉄道（富山県）は笹平～出平間の線路内に流入した土砂を撤去したが、猫又駅が河川の増水により冠水した。7月10日から宇奈月～笹平間の折返しで運転を再開する予定だ。
JR久大本線は、光岡～日田間の花月川橋りょう（大分県日田市）が流出した。再開には相当な時間がかかるとみられる。