1月14日、関西地方では大阪・兵庫・京都の各府県が緊急事態宣言の対象地域に加わったことを受けて、関西の鉄道でも一部対応する動きが出ている。いずれも減便のみで、首都圏のような定期列車の終電繰上げは計画されていない。
大阪市高速電気軌道（大阪メトロ）は、1月18日から当面の間、通常ダイヤで運行する中央線と堺筋線を除いて、平日22時以降に運行する列車のうち、2割程度減便する。
近畿日本鉄道（近鉄）は1月23日から当面の間、土休日に運行する特急を減便。2020年8月から減便している列車を含め、446本中79本が運休するが、なかでも大阪阿部野橋～吉野間の吉野特急は6割近くが運休となる。平日の特急と特急以外の一般列車、観光特急『青の交響曲』は通常どおり運行される。
阪急電鉄（阪急）では緊急事態宣言発出期限の2月7日まで、土休日に京都線で運行されている『快速特急 京とれいん雅洛』『快速特急A 京とれいん』が運休する。
京都市交通局では1月15日から当面の間、毎週金曜に烏丸線と東西線の終電を延長する形で烏丸御池を0時25分に発車している深夜列車『コトキン・ライナー』が運休する。