山陰地方を中心に再び中国地方が大雨に見舞われているため、7月12日のJR西日本では終日運休や運行見合せが相次いでいる。
JR西日本の発表によると、山陰本線では米子～浜田間で終日運休が決定。山陰本線伯耆大山～米子間、境線米子～境港間（全線）、木次線宍道（しんじ）～出雲横田間、伯備線上石見～伯耆大山間は早くとも15時以降の再開となる。芸備線では備後落合～三次間で運行を見合わせている。
また、呉線三原～竹原間では7月12日からバスによる代行輸送が開始されているが、竹原～広間では安登（あと）駅（広島県呉市）で発生した信号トラブルの影響で運行を見合わせており、再開の目途が立っていない。
なお、山陽本線は7月12日始発から全線が再開しているが、一部車両に不具合が発生しているため、山陽本線糸崎～岩国間と呉線竹原～海田市間では編成減車が行なわれている。
冠水した山陽本線糸崎駅（7月8日）。一方、島根県の一畑電車も再び全線で運行を見合わせており、今後に行なう点検で再開の可否を判断するとしている。
大雨の影響は東北地方にも及んでおり、JR東日本では羽越本線酒田～秋田間の終日運休を決定。只見線会津若松～会津川口が15時30分頃、飯山線戸狩野沢温泉～森宮野原間が15時頃の再開を見込んでいる。只見線は大白川～只見間でも運行を見合わせているが、再開の目途は立っていない。
冠水した山陽本線糸崎駅構内（7月8日）。