JR北海道は4月26日、江差線のうち末端側の木古内～江差間42.1kmの廃止を国土交通大臣に届け出た。届出上の廃止予定日は2014年5月12日。繰り上げ手続きが今後行われなければ、2014年5月11日限りで運行を終了する。
江差線は、函館本線五稜郭駅（函館市）から分岐して津軽海峡沿いに西へ進み、木古内駅（木古内町）から内陸部に入って日本海側の江差駅（江差町）に至る79.9kmの路線。木古内駅では津軽海峡をくぐってJR東日本の津軽線中小国駅に至る海峡線が分岐している。このため、函館本線函館～五稜郭間と江差線五稜郭～木古内間、海峡線、津軽線青森～中小国間が「津軽海峡線」として一体的に運転されており、江差線は木古内駅を境に運転系統が実質分離されている。
江差線の輸送人員（旅客輸送密度）は2446人（2009年度）だが、大半は津軽海峡線の列車によるもの。津軽海峡線のルートから外れた木古内～江差間に限ると、輸送密度は1987年度の国鉄分割民営化時点でも253人しかなく、2011年度には41人まで減少している。
こうした状況から、JR北海道は沿線の木古内町と上ノ国町、江差町に対し、木古内～江差間の廃止計画を2012年9月に提示。これに対し3町は対策協議会を設置して対策を検討してきた。3月28日には3町が廃止を受け入れる方向で同意したことから、今回の廃止届出に至った。
津軽海峡線に組み込まれている五稜郭～木古内間37.8kmは今後も存続するが、北海道新幹線新青森～新函館間の開業（2015年度開業予定）に合わせて第三セクター化される予定。
