日本貨物鉄道（JR貨物）は、6月18日7時58分ごろ大阪府北部を震源地とする地震の影響で、広範囲にわたる区間が不通となっており、これらの区間を発着・通過する貨物列車の運転を見合わせている。
地震で大阪ターミナル線と一部の駅・区間の設備に被害が発生している。
貨物列車が運行を見合わせているのは東海道・山陽線の米原～上郡、北陸線・米原～敦賀、湖西線・山科～近江塩津、梅田貨物線・大阪環状線・桜島線・吹田ターミナル～安治川口、城東貨物・おおさか東線・吹田ターミナル～百済ターミナル、大阪ターミナル線・吹田ターミナル～大阪ターミナル。
18日の運転中止区間を走行する予定の列車はすべて運休となる予定で、これ以外の区間でも一部列車に運休が発生する見通しで、今後、国内の物流に影響が及ぶ可能性がある。
復旧の見込みはたっていない。
