台風14号の影響により、JR九州の南九州を中心とした線区で9月22日時点も運行見合せが続いている。
久大本線（久留米～大分）では、野矢～由布院間で道床流出や築堤崩壊などが発生しているため、豊後森～由布院間で運行を見合わせており、10月上旬の再開を目指して復旧工事が進められている。
このため、特急『ゆふいんの森』全列車と観光列車の『或る列車』が当面の間、運休となる。また特急『ゆふ』は、1・2・5・6号が博多～日田間、3・4号が博多～豊後森間での運行となっている。
指宿枕崎線（鹿児島中央～枕崎）では、複数箇所で倒木などが確認されている指宿～枕崎間で9月27日中の再開を目指して復旧作業が進められている。
肥薩線（吉松～隼人）では吉松～栗野間で築堤崩壊が発生しているため、10月上旬の再開を目指して復旧作業が進められており、9月26日からのバス代行輸送が検討されている。
吉都線（都城～吉松）では西小林～えびの飯野間で築堤崩壊が発生しているため、10月上旬の再開を目指して復旧作業が進められており、9月26日からのバス代行輸送が検討されている。
日南線（田吉～志布志）では大隅夏井～志布志間で早期復旧が困難な大規模築堤崩壊が発生しているため、南郷～志布志間で運行を見合わせている。再開までには日数を要することから、9月26日からのバス代行輸送が検討されている。なお、倒木などが発生していた青島～南郷間は9月23日始発から再開する。
