JR東海は6月5日、大雨の影響で運行を見合わせていた飯田線・新城～平岡間を6月7日に再開すると発表した。
これに伴ない飯田線は全線が再開するが、当面の間、豊橋～平岡間では特別ダイヤで運行され、特急『伊那路1・4号』は全区間運休となる。
このほか、同じく大雨で運行を見合わせていた南海電気鉄道高野線・高野下～極楽橋間と鋼索線（高野山ケーブル）極楽橋～高野山間は6月6日始発から運行を再開。
6月6日に再開した南海高野線の30000系指定席特急（左）と2000系の自由席特急（右）。
土佐くろしお鉄道中村線（窪川～中村）は6月7日まで終日運休が続く。
土佐くろしお鉄道の中村駅に停車するJR四国の2700系特急。中村線と宿毛（すくも）線への特急乗入れが中止されているため、宿毛線では『あしずり6号』の代替となる宿毛9時5分発中村行き臨時列車が運行されている。