JR東日本、JR東海、JR西日本は10月11日、台風19号接近に伴ない実施する計画運休の詳細を発表した。台風のピークとなる10月12日のJR3社における運行計画は次のとおり。
■新幹線
JR東日本の各新幹線は11時以降に本数を減らして運行し、東京13時24分発の北陸新幹線『はくたか565号』を最後にすべて運休となる。なお、東北新幹線と直通する北海道新幹線や北陸新幹線長野～金沢間については、計画運休を実施しない予定。
東海道新幹線は東京～名古屋間が始発から終日運休。名古屋～新大阪間では早朝6時台に名古屋、新大阪、西明石を発車する上下各3本以外はすべて運休となる。
山陽新幹線は、新大阪～岡山間で新大阪10時台発の下り3本、西明石6時台発と岡山9・10時台発の上り3本以外は運休。これらの列車の運行終了後に岡山～広島間では『こだま』のみ、広島～博多間では『みずほ』『さくら』『こだま』のみを運行する。
■在来線
台風の直撃が予想されるJR東日本の首都圏各線では、湘南新宿ライン、上野東京ライン（上野～東京）、久留里線が始発から終日運休。9時頃からは段階的に次の各線が運休する。
＜9時頃から＞伊東線（熱海～伊東）
＜10時頃から＞東海道本線、横須賀線、京葉線、中央本線（高尾～小淵沢）、相模線、総武本線（佐倉～銚子）、成田線（我孫子～成田～松岸）、内房線（君津～安房鴨川）、外房線（上総一ノ宮～安房鴨川）、東金線、鹿島線
＜11時頃から＞横浜線、青梅線（青梅～奥多摩）、八高線
＜12時頃から＞京浜東北・根岸線、中央線快速、中央・総武線各駅停車、総武快速線、埼京線、川越線、宇都宮線、高崎線、武蔵野線、総武本線（千葉～佐倉）、成田線（佐倉～成田空港）、常磐線快速、常磐緩行線、常磐線（取手～水戸）、青梅線（立川～青梅）、内房線（蘇我～君津）、外房線（千葉～上総一ノ宮）、烏山線、吾妻線
13時頃～／山手線、南武線、鶴見線、五日市線、両毛線、上越線、信越本線、常磐線（水戸～いわき）、水戸線、水郡線、日光線
特急は、『スーパービュー踊り子』『踊り子』『あずさ』『かいじ』『ひたち』『ときわ』『わかしお』『しおさい』『新宿さざなみ』『新宿わかしお』『日光』『きぬがわ』『スペーシアきぬがわ』『草津』『あかぎ』の全列車が終日運休。『成田エクスプレス』は東京11時3分発、成田空港12時20分発以降に運休する。
なお、10月13日については、少なくとも昼頃までは始発から運休するとしている。
このほか、JR東海では一部の線区で終日運休を、JR西日本では北陸・京阪神・和歌山・山陰の各線で計画運休を実施する可能性があるとしている。
