JR北海道は4月15日、札沼線北海道医療大学～新十津川間の最終運行日を繰り上げると発表した。
予定では5月6日限りの運行となっており、4月11日から増発対応を行なっていたが、新型コロナウイルスの感染拡大や緊急事態宣言の発出に鑑み、ゴールデンウィーク前の4月24日限りで一般営業運行を終了することになった。JR北海道では「このような決定をせざるを得ないことを深くお詫び申し上げるとともに、ご理解くださいますようお願い申し上げます」としている。
なお、新十津川発着列車については、4月14～17日が2両編成、4月18～24日が4両編成となり、4月27日には沿線4町民を対象にしたラストラン運行を行なうが、これについては「町外からの来駅、沿線での写真撮影等をお控えくださいますよう、重ねてお願い申し上げます」とアナウンスしている。
感染症拡大という、かつて例を見ない状況下での廃止となるだけに、JR北海道では「できる限り町外からのご乗車、来駅、沿線での写真撮影等をお控えくださいますよう、お願い申し上げます」と呼びかける一方、乗車する場合は、発熱症状がある場合の自粛やマスクの着用をお願いするとしている。
また、換気に配慮して窓を開けての運行となるため、室温低下に備えて暖かい服装で乗車してほしいとしており、不測の事態により最終運行を繰り上げる場合があることも示唆している。
