JR九州は1月27日、令和2年7月豪雨の影響で長期不通となっていた久大本線豊後森~庄内間が、3月1日までに再開することに伴なう運行計画を発表した。
同区間のうち、2月13日始発から再開する由布院~庄内間では、2月28日まで上り18本・下り19本の列車が運行される。
豊後森~由布院間が再開する3月1日からは、大分23時25分発向之原行きが運休する以外は、久大本線全線が通常運行に戻り、特急『ゆふいんの森』は博多~由布院・別府間、特急『ゆふ』は博多~大分・別府間の運行となる。
また、クルーズ列車の『ななつ星in九州』は、4月3日出発分から久大本線に乗り入れるコースが再開される。
豊肥本線宮地駅で折り返すルートに変更されている『ななつ星in九州』。久大本線全線再開後は豊肥本線~久大本線をフルに乗り入れるルートに戻ることに。なお、久大本線全線再開を記念して、3月1日には『ゆふいんの森1号』の博多発車時、『ゆふいんの森2号』の由布院発車時に出発式が開催される。