災害や事故などによる鉄道路線の長期運休区間は、1月末時点で478.2km。2016年12月末に比べ2.7km増加した。1月は大雪の影響により各線で運転の見合わせが相次いだが、現在はいずれも再開している。
一方、和歌山県御坊市内の御坊～西御坊間を結ぶ紀州鉄道線で1月22日、脱線事故が発生。この影響により現在も全区間で運転を見合わせている。
運輸安全委員会の発表によると、列車が御坊駅を出発し、約500m進んだところで運転士が衝撃を感じて停車。後方の台車が進行方向左側に脱線していた。同線を運営する紀州鉄道は「事故原因を監督の国土交通省と調査するとともに、復旧作業を行っております」としているが、再開時期のめどは立っていない。
一部不通となっている大井川鐵道の井川線は、3月11日に全区間の運転を再開することが決まった。常磐線の浪江～小高間も、早ければ3月末にも再開すると見られる。
