6月18日22時22分に発生した山形県沖を震源とする最大震度6強の地震により、山形県内を通過するJR東日本羽越本線と陸羽西線が甚大な被害を受けた模様だ。
国土交通省が6月19日8時に発表した速報によると、羽越本線では同日7時の時点で、鶴岡市内の小岩川駅でホーム損傷や電化柱の傾斜が、三瀬（さんぜ）駅でホームの亀裂が判明。また、酒田市内の東酒田駅ではホームの損傷が判明したとされている。
これにより、羽越本線では村上駅（新潟県村上市）と酒田駅（山形県酒田市）の間で運行を見合わせており、13時2分時点で運行再開の目途は立っていないという。代行輸送は行なわれていない。
また、陸羽西線では13時2分の時点で、古口駅（山形県戸沢村）と余目（あまるめ）駅（山形県庄内町）の間が線路点検中で、こちらも運行再開の目途は立っていないという。
羽越本線では新潟～秋田間の特急『いなほ』が始発から全面的に運行を見合わせていたが、酒田～秋田間では秋田行き『いなほ5号』（酒田の所定発車時刻は14時41分）から運行を再開するとしている。
また、JR貨物の貨物列車は、12時時点で羽越本線や信越本線で運行している9往復が運休したという。